https://frosthead.com

האם מחשב בעל ניסיון בגנום יכול לעזור לשנות את הדרך בה אנו מטפלים בסרטן?

במשך שנים המלחמה בסרטן עוסקת בתקיפת חלקי גוף ספציפיים - פיתוח טיפול ומימון מחקרים סביב סרטן ריאות, למשל, או סרטן שד או מוח, לשם שמות אחרים.

תוכן קשור

  • האם רצף הגנום יהפוך אותנו חכמים יותר להתמודדות עם מחלות בגנים שלנו - או סתם חרדים יותר?

אך מסתבר שהמחלה מורכבת יותר: מדענים יודעים כעת כי בעזרת ניתוח גנטי הם יכולים לתקוף מוטציות ספציפיות של תאי סרטן ולא רק את האיברים בהם הם מופיעים. וכך המאבק בסרטן נכנס לשלב חדש, כזה שמתמקד בפיתוח טקטיקות ותרופות למאבק בתאים סרטניים לפי תא.

אחת המשימות המרתיעות ביותר בקהילה הרפואית, למשל, הייתה לא רק פיתוח תרופות העומדות בקצב הדרכים הרבות של סרטן לתפוס את גופו של המטופל, אלא גם למצוא תרופות שיגיבו למומים ספציפיים; במקרים מסוימים, על הרופאים לעבור סם אחר תרופה עם מטופל במטרה למצוא טיפול יעיל.

הקיץ, חוקרים באנגליה יוכלו לעשות צעד גדול קדימה בעיצוב גישה מתוחכמת יותר לתקיפת תאים סרטניים על ידי זיקוק איך מחקרים קליניים בוחנים טיפולי סרטן חדשים. למרות שזה לא נשמע טרנספורמטיבי, זה יכול לעזור לחולים לגשת לתרופות יעילות במהירות רבה יותר.

ברוב הניסויים הקליניים החוקרים בודקים רק תרופה אחת שניתנת באופן אקראי לחולים שתוצאותיהם נמדדות מול אלו המקבלים תרופת בקרה או פלצבו. אמנם זה משרת את מטרות החוקרים, אך לעתים קרובות זה לא עושה הרבה עבור חולים המקבלים את הפלצבו; כמו כן, חולים שהתרופה החדשה אינה יעילה חייבים לחכות לניסוי נוסף שינסה תרופה אחרת.

עם זאת, ניסוי זה עתיד לבחון עד 14 תרופות שונות, המסופקות על ידי החברות הווארמוציוניות AstraZeneca ו- פייזר, על חולים בסרטן ריאות מתקדם. מדענים יבדקו דגימות של גידולי החולים עם תחילת הניסוי, ויוקצו תרופה המבוססת על חריגות שנמצאו בתאי גידול נתון.

15 עד 20 חולים יקבלו כל אחת מהתרופות. תרופות שמצליחות יכולות להיות מעקב מהיר לשוק; אלה שאינם כאלה יכולים להיפטר במהירות. למשפט ניתן להוסיף עוד תרופות למשך הזמן.

הגישה לא רק מסלקת את האקראיות, היא גם נותנת לרופאים תובנה טובה יותר באילו תרופות פועלות למומים מסוימים. אם הצליח, הניסוי יכול להיות שאונקולוגים יתמקדו הרבה פחות בגוף בו התפתח סרטן ובמקום זאת יפסיקו את המוטציות בתאים שגרמו לסרטן. התקווה: טיפול בהתאמה אישית שכזו יהפוך את הסרטן מהרוצח למחלה כרונית הניתנת לטיפול באמצעות תרופות.

עבודה עבור ווטסון

אחד האתגרים הגדולים ביותר של הטיפול בהנחיית ניתוח גנטי הוא הנפח העצום של המידע שרופאים צריכים לקלוט כדי לפתח תוכניות מותאמות יותר.

כל יום מדענים מגלים גילויים חדשים על רצף ה- DNA של תאי סרטן ואילו מוטציות מזיקות, אך אין מקום שרופאים יכולים למצוא מחקר זה. במקום זאת, הם צריכים לסרוק כתבי עת רפואיים ורשומות קליניות, תהליך רב זמן ומרתיע.

זה נשמע כמו סוג העבודה שמטפל בצורה הטובה ביותר על ידי מחשב סופר. וזה מה שהמדענים במרכז הגנום של ניו יורק נערכים לעשות. בחודש שעבר הודיעה העמותה למחקר ביו-רפואי על שיתוף פעולה עם יבמ בכדי להשתמש בווטסון, מערכת המחשוב החזקה להפליא הידועה בעיקר בזכות אלופת ג'ופרדי אנושית בטלוויזיה הלאומית, למחקר גנטי.

מאז הרגע המאיר שלה כמתמודד בתצוגת משחק, ווטסון אכלה יותר מ 23 מיליון תקצירים רפואיים. ובגלל יכולתו להבין שפה ולהעריך השערות, ווטסון יכול לחרוג מאחסון נתונים כדי למצוא בה גם משמעות.

לצורך מחקר הפיילוט של מרכז הגנום בניו יורק, ווטסון יתמקד בגליובלסטומה, התוקפנית ביותר בגידולי מוח ממאירים. מדענים ישתתפו ברצף הגנום של גידולי המוח אצל 20 מטופלים ואז יעבירו את הנתונים לווטסון.

תפקידו של המחשב הוא לזהות תחילה את המוטציות בתאי הגידול השונים. בהתבסס על כמות הידע הרפואית שצברה, ווטסון תספק אז השערה כיצד מוטציות אלו גורמות לסרטן (חלק ממוטציות סרטן, למשל גורמות לתאים להתעלם מאותות להפסיק לצמוח בעוד שאחרים מעוררים את צמיחת כלי הדם הסמוכים). לבסוף, ווטסון תיצור רשימה של תרופות שיכולות להיות יעילות לטיפול בסוגים שונים של מוטציות תאים - חלקן אולי מעולם לא שימשו לטיפול בסרטן לפני כן.

בסופו של דבר, על מועצות בתי החולים לשקול את המלצות הטיפול של ווטסון; כל בית חולים נתון יכול להחליט להשתמש בתרופה אחת או בקומץ מהם. אך כך או כך, אם ווטסון מבצע את ההרמה הכבדה מאפשר לרופאים להעניק לחולים טיפול יעיל הרבה יותר מהר ממה שיכול היה להיות באמצעות ניתוח אנושי בלבד.

נהיה אישי

להלן כמה התקדמות אחרונה במחקר סרטן:

· כוח אספירין: מחקר חדש שפורסם בכתב העת Science Translational Medicine מצא כי נטילת אספירין יומית עשויה להפחית את הסיכון לסרטן המעי הגס בקרב אנשים שיש להם רמה גבוהה של סוג מסוים של גן במעי הגס שלהם.

· גילוי מוקדם: חוקרים מאוניברסיטת סטנפורד אומרים כי הם המציאו שיטה דרכה ניתן לאתר סרטן ריאות באמצעות בדיקת דם פשוטה. בטכניקה זו הם זיהו כ 50 אחוז ממשתתפי המחקר עם סרטן ריאות בשלב 1 וכמעט כל החולים עם סרטן ריאות מתקדם יותר. הם מאמינים כי גישתם בסופו של דבר עלולה לאפשר בדיקות דם לגלות סוגים רבים של סרטן.

· בדם: בינתיים, במרכז סרטן קימל באוניברסיטת ג'ונס הופקינס קימל, מדענים אומרים כי פיתחו בדיקת דם שיכולה לאתר את הישנות סרטן השד ברמת דיוק של 95 אחוז. הבדיקה מסוגלת לעקוב אחר 10 גנים ספציפיים לסרטן השד בדם של החולים.

· כאשר תרופות לסרטן נכשלות: צוות חוקרים מהאוניברסיטה העברית אומרים שהם זיהו את התהליך שבאמצעותו גידולים הופכים עמידים לתרופות מסוימות. והם מאמינים שזה יכול להוביל לדרך אמינה לחזות אילו מטופלים יעזרו בכימותרפיה ולהתאושש ואילו התרופות לא יעזרו להם.

האם מחשב בעל ניסיון בגנום יכול לעזור לשנות את הדרך בה אנו מטפלים בסרטן?